终明一代，先后出现王阳明、王廷相、李贽、黄宗羲、王夫之、顾炎武等等大家，这些人各成流派，又相互综合，将中国思想文化推向新的高峰。
这样的明朝，究竟又是被怎样误读和拉黑的。
这其中，一个最重要的原因就是代明而起的清朝的蓄意丑化。
满清是取代明朝入关确立统治的，为巩固自身统治，彻底断绝广大汉族百姓复兴明朝的希望，在民俗、思想、文化方面进行了有预谋，有系统的大量删除、丑化工作。民俗方面，强迫汉人蓄留满族发式，发布臭名昭著的“留发不留头，留头不留发”的命令；思想文化方面，大力钳制禁锢知识分子，大兴文字狱，随意指摘文学作品中的一字一句，使文学创作成为读书人的畏途，使学术自由受到极端限制，人们的思想受到严重束缚。
读书人为了逃避文字狱的风险，不再去关心政治、经济、科学发展，只是一味埋头八股文，导致思想僵化，科技倒退。
特别是在清朝乾隆年间，满清借修纂四库全书之际，对中国文化进行了一次系统性的浩劫，将对满清统治不满，不利的，对明代进行缅怀的书籍进行焚毁和篡改，实际上是对历朝文化典籍的一次阉割。
清朝政府召集御用文人花费百年时间修明史，将明朝历史按照自身意愿加以篡改和删除，致使我们现在看到的明史和真正的史实之间有着很大的差距。
后世的影视作品中充斥着大量正面描写满清的作品，诸如康熙大帝、雍正王朝等，而对明王朝少有正面描写。
开国皇帝朱元璋的大杀功臣，整顿吏治，充其量只是上层权利分配的又一次洗牌而已，得到实惠的是下层百姓；被人诟病的明朝几个皇帝的行为乖张，并没有影响他们对国家大事的决策和判断，明朝皇帝突出的特点是普遍大事不糊涂。
万历年间著名的三大征也是在万历的亲自决定下进行的；大奸大恶的魏忠贤迫害的是政治对手东林党人，政治斗争的残酷性决定了双方只能以死相搏。
但比较魏忠贤和所谓清流的东林党的执政业绩，魏忠贤执政期间，国事可控，对内没有大规模的农民起义；对外任用非自己一党的孙承宗等人，对后金采取攻势；而东林党人上台后，国事尽坏，不可收拾；所谓的锦衣卫、东厂、西厂等特务机关更多是妖魔化了。<