次日凌晨，赵宪阵中义军大部仍在梦中，锦山城门大开，小早川隆景、立花宗茂引兵杀向赵宪，义军哨兵慌乱。
赵宪闻听喊杀声起，急令全军迎战，但日军主力已近在咫尺，伏兵已然杀至，义军大乱，赵宪率众拼命反抗，并激励部下道：“性命唯有一次，必当轰轰烈烈，为国为民，杀尽倭寇！”
然而，军心士气固然是冷兵器时代的制胜法宝之一，但如今却已经是冷热兵器交替时节，而日军不仅人多势众，且装备精良，配合得当，杀伤力之巨大亦非古时可比。
赵宪之子身批启赋战袍，本想吸引敌军，便于赵宪逃脱，但日军铁炮火力密集，赵宪之子顷刻中弹身亡。此次激战之后，赵宪及七百义兵无一生还，而小早川隆景大胜之后，日军则有序退回锦山。
次日，赵宪弟子率小股义军赶至，发现遍地尸骸，便聚拢合葬。三日后，灵圭领僧兵进攻锦山，灵圭闻听赵宪死讯，悲愤莫名，立誓要为赵宪报仇。
灵圭领僧兵巧借山势与日军周旋，连战三天三夜。僧兵骁勇，且因身份关系而信念坚定，再加上日军多有信佛之人，对与僧兵作战颇有顾虑，导致战况变得有些拉锯。
小早川隆景严令死守，不断调整布防，铁炮手居高临下昼夜射击，直到发现某次僧兵孤注一掷的全军压上，他才下令打了一次短促突击。这次突击正是在关键时刻打出了关键效果，导致僧兵全灭，灵圭战死。
如此一来，自高敬命、赵宪、灵圭等人相继战死锦山之后，全罗、忠清、庆尚三道各地义军尽皆愤慨，隔三差五便零散行动或集结进兵，前赴后继向锦山发动进攻。
小早川隆景本想以锦山作为攻占全罗道之据点，却意外发现自己居然成了众矢之的，反而导致被困于锦山城中，连日——哦不对，是连月以来疲于防守，这般情况实在令这位日军智将也深感头疼。
而庆尚道的毛利辉元第七军则在剿灭义军中进展不佳，甚至搞得军师黑田官兵卫亲自从汉阳赶至庆尚道予以援助。
黑田官兵卫了解了当地战况之后，请毛利辉元大遣诸将分布各城、收拢民心。至于黑田官兵卫自己，他则亲领三千精锐，先后于各城设诱敌之计，故意示弱，诱导零散义军入围斩杀，再安抚百姓，直至地方稳固。
同时，他一并令吉川广家领军一万，紧盯郭再佑所部，步步推进，压缩其游击区域，联合第九军逼迫郭再佑等各部义军退至晋州。
在这一阶段中，日军陆上的表现大抵如此，接下来该说一说海上方面了。
却说自李舜臣在与日军的海战中连战连捷，丰臣秀吉得知后勃然大怒，严令水军大将九鬼嘉隆反击李舜臣。
九鬼嘉隆其实现在一个头两个大，原因是他既肩负海运线路保障，但又无法调集日军水军的主要战力。此时日本水军真正的主力一直留在大坂附近，用以防备尚未与日本“达成协议”的北洋海贸同盟关东舰队突袭大坂城，毕竟大坂才是丰臣秀吉的老巢，大坂若是有失，他九鬼嘉隆灭族只怕都是轻的。
九鬼嘉隆无奈，只好请胁坂安治率水军运输舰队主力七十三艘战船出战，另外又请加藤嘉明、藤堂高虎率队从旁策应。
胁坂安治传见部将胁板左兵卫、渡边七卫门、直锅佐马允三人议事。会上，胁坂安治道：“李舜臣那厮令我水军威名扫地，此次太阁殿下已经下达严令，务必歼灭朝鲜水军！此战，我七十三艘战船分为三队齐头并进，你们各领一队，先在巨济岛集结，等待战机。”
胁板左兵卫对战况颇为忧虑：“太阁殿下严令自然可畏，但我水军主力此时不能轻离大坂，朝鲜所造之龟船却又不可小觑。自目前为止，尚无有效的应对策略。
我等此前私下都曾商议，若要破他那龟船，非得从北洋海贸同盟购得的那批巨舰不可，甚至还需要为那些巨舰加装和明人巨舰一样的大量大筒(火炮)，但如今这些都没有，此番再战之时必对我方造成麻烦。”
渡边左兵卫亦同有此虑：“是的，九鬼殿下，眼下我军战船都是原有的老船，十分缺少大筒，战法只得以接弦为主，而相较朝鲜水军其他将领，这李舜臣指挥得当，若两军船队规模相当，恐怕胜负难料。”
直锅佐马允见二人如此颓废，极为不满，对二人道：“二位怎么变得如此懦弱？莫非我们毫无优势不成？我还偏就不信了，这朝鲜龟船射不穿、打不烂？朝鲜水军的大筒可不是明人的大筒，就凭他们那些大筒便能决定胜负？我认为关键仍然在于我军的布阵谋划，需从一开始便完全掌握局势！”
这里提到朝鲜火炮的问题，其实前文曾经说过。大明对朝鲜固然一直视为相对比较老实的藩邦，但其实也一直保持着戒心，两百年来一直对朝鲜实行颇为严格的火器、火药出口限制，至于其中威力最大的火炮，那当然是最为严格限制的部分。
这一来，也就导致朝鲜的火炮水平一贯较低，虽然相比于此前一直专著铁炮(火绳枪)而几乎没有怎么发展大筒(火炮)的日军要强一点，但也就是“有胜于无”的差别。
按照此时日本水军将领们的想法，这个问题要解决其实也不难，只要大坂城那边的新舰队开过来就行，毕竟那些从京华购买或者改进的巨舰本来都是有火炮的，现在面对龟船这一之前未曾料到的大敌，