马千乘夺下铜柱关后并不愿意休息，继而向铁柱关冲锋，但这次连战两日仍未攻克，所部反而损失不小，随即听令撤兵，由董一元率部接替。
董一元部主力乃是秦兵(陕西兵)，悍勇倒是悍勇，但是也不太适应播州这种山地战，同样先来了个“强攻两日不克”，其部明军屡次攀上关璧便被苗兵击落。苗兵方面，与铜柱关相比铁柱关的防守又更为顽强，这铁柱关后多用石柱直接抵住关门，苗兵蜂拥至关墙，每逢明军来攻便殊死力战。
随着铁柱关前积尸日多，董一元心生一计。这日正值雨后大晴，山中高温潮湿，董一元令人于铁柱关前焚尸，阵阵恶臭袭来，令人遍生呕意，苗兵渐渐不敢近前。
董一元立刻组织敢死队，全身防护之外，还口蒙鱼腥草汁液浸泡过的厚布抵挡尸毒恶臭，腰挂首级，手持血刀，借助焚尸黑烟笼罩，向铁柱关再次发起冲锋，其后明军大队紧随冲关。
这支明军突袭而至，由于显得血腥可怖之极，少数不曾后退躲避尸臭的苗兵也不由心惧而大溃，董一元因而一举夺下铁柱关。
董一元夺关后就地休整，清理战场，而由马林统军继攻飞虎关。
飞虎关前三十六级天梯高陡异常，而周围则是悬崖峭壁，飞猿难渡。明军拾阶而上都需手脚并用，而播州军不仅推下滚木山石，还浇灌火油，引燃山道，继而再用弓箭远近阻击。
明军又不是铁打的金刚，在这种狭窄山道上进攻自是苦不堪言，根本难以寸进。马林乘间隙连发三次冲锋，结果反倒是明军伤亡激增，军心险些崩溃，马林见状只得先行休兵。
这飞虎关真是个天险，上倚绝壁，下临悬岩，高屋建瓴坐镇天梯之顶，如负隅猛虎，张口啸天，威震关山。其箭楼也屯驻重兵，守关之兵亦为播州精锐虎兵坐镇。而天梯与飞虎关之间仅有一道吊桥连接，为通向飞虎关的唯一通道。
马林部于飞虎关前连攻十日，偏又阴雨不断，委实寸步难行，毫无斩获。马林心愁不已，他一个善于打平原野战的骑兵将领，竟然不得不苦思夺取山关之计。
好在这日天气转晴，马林大喜之下，急令密调本军全部三号炮上山，在确保不会误击吊桥的前提下，猛烈炮击飞虎关楼以压制播兵。
播州军根本没有料到这种地形下明军竟然能调集大量火炮，对此毫无防备，此时突遭火炮打击，关石飞溅，关楼塌陷，播州兵于关墙之上难以立足，飞虎关守兵一时间再难向明军施以还击。
马林见机不可失，立刻点检精锐家丁，亲自领兵冲过吊桥猛攻关门，于是飞虎关破，明军鱼贯而入，随即便与播州虎兵展开混战。
播州虎兵相当于黄芷汀当年身边的亲卫，全家都和主家一荣俱荣、一损俱损，故而不畏生死，死战不退。
由于关门狭小，明军又为了尽早攻陷而一拥而入，此时陡然遭遇虎兵这样的精锐山地兵堵截，差点被一下子逼出关门。
马林急得大吼连连，亲自督阵，不顾危险站在高处鼓舞士气，又令身边家丁以掌心雷齐掷，这才险险逼退敌兵。随后明军大队再度冲锋，奋勇反击，终于陆续再入关门。
进关的明军多起来之后便算是大局已定，结阵挺枪摆出排枪刺刀阵，步步进逼。虎兵虽然精锐，但在高务实这套超越时代的打法面前也终于再难寸进。
马林在排枪刺刀方阵打出数轮齐射之后一声令下，开始全军冲杀。他本人也不甘示弱，拿出先父马芳的气势，身先士卒连斩十余人。虎兵虽然精锐，但毕竟人数不多，在这般大军强压之下终于不敌，最终全军覆没。
飞虎关战后，刘綎率部跟上，向飞龙关攀进。飞龙关由何汉良、田飞鹏率兵镇守，前有龙虎大道，与三十六级天梯相仿。
这飞龙关一侧临百丈深渊，险峻阴深，蛇鼠为窟，常有哀嚎之声随阴风阵阵从山涧下传来，令人毛骨悚然。
何、田二人意欲使明军全部葬身山涧，特在龙虎大道遍置木石，辅以弓箭迟滞明军攻势，更用自制火药在明军进攻时突然炸裂一侧山体，乱石飞下，明军躲闪不及，多有坠崖而死。又是连续两日，明军大半仍被迟滞在龙虎大道。
刘綎大怒，亲自督战并派出五百降倭夷丁，严令向飞龙关突进。降倭夷丁不愧是天下精锐——尤其是在刘綎暴怒之下，他们这一出动，直杀得沿途血肉横飞，在自身死伤近半的情况下终于冲过大道。
降倭夷丁常年只维持在三千出头，此番为了夺取区区一个关城的前方大道就损失了两百余人，即便是刘綎这种战狂分子也不由为之心疼。
刘綎抬头观望飞龙关，乃是用青石及石灰糯米砌筑而成，关为三开，三拱相套，有两座月门，是为囤东入大城门户所在。刘綎率部对飞龙关时攻时休，接连相持十日而不克。
由于此处近乎绝地，刘綎干脆弃用计谋，只作强攻，逢阴雨连绵便冒雨强攻，逢云开雾散便调火炮助阵。于是连日来战事激烈，炮声如雷，龙岩囤上下皆能清晰耳闻。
轮番强攻之下，飞龙关即便再如何险要也渐渐难以支撑，于是杨朝栋又率部来援。此时飞龙关一侧关墙断裂，明军趁势大举攻入，刘綎随军突入飞龙关内，直取何汉良、田飞鹏